草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿平台最喜欢见的发病中之一。肾安排中CaOx纳米线过过剩磨合会导致肾小管人体细胞影响和凋亡，才能导致肾结石的转变成。短链碳水化合物酸由肠腔内活性污泥法日常细菌堆肥营养健康化学纤维导致，不但在小面积的肠腔深层中推动使用，还有就是在平台总体水平上也推动首要使用。当中，丁酸是最极为丰富的短链碳水化合物酸，具备抗体可以抑制和抗体可以抑制使用,本实验浅议丁酸对CaOx肾结石的使用还有隐藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿内科吴忠教受、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠硕士生导师、周子健博士后在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了线上药理学学保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

内容明称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 的客户机关单位：华山大医院 理论研究人：大鼠、HK-2人体细胞 分组名信息内容：比对组（Con）、建模方法组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示 技术工艺：网洛临床药理学查重

设想步骤图

论述报告单

探索员工前提构筑大鼠建模方法，能能通过生理方面生物化学评价指标和组织结构方面的问题学上色等探索法律手段发掘丁酸能能缩短CaOx建模方法大鼠肾CaOx纳米线的转变成和断裂，调节CaOx建模方法大鼠的细菌感染断裂和空气硫化东西的无限表达出来。于此，丁酸还可可以抑制草酸引导的HK-2上皮细胞膜断裂、空气硫化应激性和上皮细胞膜凋亡。 为探究性丁酸成分类型和靶DNA互联网，探析员工从PubChem收集丁酸和丁酸酯的二维和3d成分类型（图1A）。通过PharmMapper动态数剧库查询和Uniprot动态数剧库查询清理后共选择出1115个丁酸靶DNA供进而骤分享。将DNA数据文件库倒入STRING动态数剧库查询，通过PPI互联网分享。Cytoscape拿出了顺序的前20的核心靶DNA的祥细互联网图，包扩CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样的核心DNA与互联网中的另外的DNA均核心表现出务必的关联性，解释这样的DNA几率起着着融合普通机械生理反响。GO和KEGG分享呈现了丁酸核心DNA的相关联于方式和微生物体学效果（图1C）。核心DNA核心与类固醇刺皮质激素回复、防氧化物应激状态状态回复、普通机械活化氧体细胞对类固醇刺皮质激素刺激性的普通机械生理反响和对含酸性普通机械有机物的普通机械生理反响相关联。与此同时所讲，这样的核心DNA核心参与活动了防氧化物应激状态状态和对普通机械活化氧的微生物体普通机械生理反响的过程 ，是肾结石确立机制化中至关根本的方式，这反映丁酸几率在肾结石中起着根本普通机械生理反响。

图1| 丁酸组成与靶表观遗传网数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为再次一个脚印宇宙探索丁酸对CaOx肾结石真的切靶人类dna，实验工人能够 GEO数据统计表库对GSE73680中键康差表与CaOx肾结石病人的人类dna对比完成了实验。差表组与CaOx结石病人的重要性对比表示人类dna（DEGs）人类dna组检测标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个人类dna发生了重要发展，在其中3379个（89.4%）人类dna表示上浮，404个（10.6%）人类dna表示调低（图2A）。对DEGs完成聚类分析法算法概述，热图呈现了前10个被选中DEGs的二维分层现象聚类分析法算法特殊性（图2B）。很快，实验工人能够 GeneCards数据统计表库人工客服鉴别了370个很有可能与CaOx肾结石相应的的人类dna，排列前20位的予测人类dna举例相应的性评级如下图2C如下。方便查找丁酸的治疗CaOx肾结石的关键点靶点，实验工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的人类dna操作能够 了了个Venn图。终极，CYP2C9被制定为丁酸印象CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。不但，实验工人还完成了丁酸与CYP2C9的碳原子指导，CYP2C9的多个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间效果，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在根据线上药学学分折CYP2C9是丁酸应响CaOx肾结石的靶遗传基因后，探索工作员还进行細胞实验设计核实了CYP2C9可降低了草酸诱导性的HK-2細胞的ROS标准、慢性炎症挫伤和凋亡。

图2| 半数以上据库合力进行分析分折CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶人类基因

研究分析没想到

本探索前提察觉丁酸在身体之外和休内均能治理和改善CaOx肾结石模型工具的空气氧化的应激反应反应和发炎病变磨损，陆陆续续借助网洛临床药剂学学建立拥有丁酸影响力CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9，还有借助内部核实验性印证CYP2C9在草酸盐诱惑的HK-2内部核ROS品质、发炎病变磨损和凋亡。哪些察觉表达丁酸将借助治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的空气氧化的应激反应反应，消减发炎病变磨损。哪一具体步骤中拜谱生态学打造了网洛临床药剂学学技能服务质量于，凡此种种拜谱生态学可增强比较成熟完美的人类基因组学、球营养物质组学、细胞代谢组学等多个学成品及技能服务质量于，喜欢致电的方式管理咨询！ 考生医学文献：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.