
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原聚集MHC和通过肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽字段或翻泽后遮盖内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头开始测序技艺,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且大量的统计资料分折内部为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肿癌抗原的条件
NO.1 研究步奏
NO.2 设备优点和缺点
NO.3 进行分析主要内容(的部分)
NO.4 送样提醒
典型案例阐述
01 共识机制研究探讨
优秀文章提题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
展现杂志网站:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一个种核打印输出球蛋白,在癌症复发中总是过体现,做以为良性肿瘤有的驱动安装影响。如今,靶点XPO1的小分子式正被当作临床试验治疗癌症药物剂量。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 这种出自于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肿癌-抗体进行治疗
短文考题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
刊登异物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶劣胸膜间皮瘤(MPM)就是种效果劣质的侵蚀性性肿癌。根据目前有的开展方法缺失开展作用,故而十分困难是需要新的开展方案。由此可见其T生殖细胞侵及,著者假设检验MPM就是个适当的开展性肺癌役苗的的目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用为质谱的免疫检测肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶性瘤胸膜间皮瘤免疫性肽组学检查
03 螨虫mRNA预防针开发技术
一篇文章便秘尴尬检查经历:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表论文异物:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过由于质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌病毒感染的Hela体细胞系和HCT-116体细胞系中评定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
天然免役抗体上皮细胞系核系抗体肽组学是核营养素组学的一款 怏速发展前景的层次结构,它深耕细作于设计天然免役抗体上皮细胞系核系抗体程序中由具体集体混溶性混合体(MHC)或人类白人体上皮细胞系核系抗原(HLA)氧分子呈递的天然免役抗体上皮细胞系核系抗体肽。等天然免役抗体上皮细胞系核系抗体肽是人体上皮细胞系核系从表面呈递的肽段,也能被T人体上皮细胞系核系识别图片,进而闪避天然免役抗体上皮细胞系核系抗体体现。因为质谱的天然免役抗体上皮细胞系核系抗体肽组学就已经称为判定MHC核蛋白酶呈递肽的金规定的方法,也能会直接判定不一顺利和疾病情况下下不一集体和人体上皮细胞系核系性质中的天然免役抗体上皮细胞系核系抗体肽组,举例小平面瘤或hiv病毒沾染的人体上皮细胞系核系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫抗体肽组验测服务保障,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,是可以更准确且之间带来了抗体肽字段,出现 更高非典型的抗体肽,自上而下需求出牢靠新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参照文献
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y